Caracterización filogenética, clonal, genotípica y plasmídica en una colección de genomas de Escherichia coli O25:H4 y análisis del operón fimbrial ucl
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Date
2022-01
Authors
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Publisher
Benemérita Universidad Autónoma de Puebla
Abstract
"E. coli patógena extraintestinal (ExPEC) es un patotipo asociado, entre otras patologías, al desarrollo de ITU, una de las infecciones bacterianas más comunes, con aproximadamente 150 millones de casos al año. En ocasiones no son diagnosticadas adecuadamente, provocando complicaciones o cronicidad, además de su adquisición nosocomial y comunitaria. Dentro de las ExPEC, el clon O25:H4- B2-ST131 se ha asociado a ITU y sepsis, principalmente por su posesión de genes tanto de virulencia como de resistencia y dentro de este complejo clonal, el subclón ST131-H30-Rx se considera pandémico. El objetivo del presente trabajo consistió en analizar las características de filogenia, clonalidad, patogenicidad y plásmidos en genomas de cepas E. coli O25:H4 obtenidos en bases de datos de libre acceso usando herramientas bioinformáticas para el análisis. Esta investigación se centra en analizar determinantes genómicos, tanto en cromosoma como en plásmido, de un conjunto de genomas de cepas clínicas O25:H4 aisladas de sangre, orina y heces en distintas partes del mundo, incluida una cepa mexicana, para conocer la caracterización genotípica del clon ST131, así como de 3 subclones que derivan de este grupo: H30-Rx, H30-R y No H30 con la finalidad de conocer los determinantes propios de cada ST131 y subclones".